Modrá planeta se ocitla na pokraji zkázy vinou intrik mocné organizace Cobra, která má s G. I. Joe nevyřízené účty. Jak moc leží jejím vůdcům v žaludku, se ukáže ve chvíli, kdy rafinovanou lstí ovládnou Bílý dům a z Oválné pracovny označí příslušníky této jednotky...
Elitní tým profesionálů G.I. Joe vybavený nejmodernější špionážní a vojenskou technikou neúnavně cestuje po celém světě. Bojuje proti zbrojařské firmě Destro a potírá vzrůstající vliv nebezpečné tajné organizace Kobra, která se snaží uvrhnout svět v chaos.
Dvě atomové ponorky zmizeli beze stopy a svědectví na mikrofilmu nasvědčuje, že jejich přísně utajené trasy byly narušeny tepelně naváděcím systémem. James Bond, který dostal rozkaz aby se spojil se sovětskou agentkou Anjou Amasovou, se potýká s mocí posedlým Karlem...